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BB贝搏ballbet官网平台 - 绘谱导读 | 2022年10月代谢组学文献精选
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导读目次1. Cell Reports | 禁食促使免疫医治对于低免疫原性乳腺癌有用同时削减副作用2. Cell | 饮食糖引起的微生物群掉衡粉碎免疫介导的代谢综合掩护3. ISME | 以基因组为中央研究奶牛胆汁酸代谢微生物群及其相干饮食引诱的功效影响4. Arthritis Rheumatology | 年夜动脉炎的微生物组、代谢组以及脂质组的变化5. Science Advances | 生酮饮食展现了脑细胞差别的代谢可塑性6. Science I妹妹unology | 常驻TH2细胞在相近传染的部位协调脂肪构造重塑7. Gastroenterology | 组卵白甲基转移酶可调治T细胞脂质代谢以影响肠道炎症8. Eur Respir J | 肠道菌群代谢物虎魄酸加剧小鼠肠道缺血/再灌注后急性肺毁伤1、 Cell Reports | 禁食促使免疫医治对于低免疫原性乳腺癌有用同时削减副作用三阴性乳腺癌约占乳腺癌的15%~20%,具备极易复发以及转移的特色,并且预后较差。免疫查抄点疗法在三阴性乳腺癌的医治中得到必然进展,但亟需辅助手腕提高医治效果,已经有研究发明禁食模仿饮食能激活免疫体系,或许其可辅助免疫查抄点疗法提高药效。本研究赐与三阴性乳腺癌荷瘤小鼠FMD干涉干与,发明其有用提高免疫查抄点疗法的效果,而且在节制肿瘤的同时,削减药物的毒副作用。1. 先给哄骗4T1乳腺癌细胞成立小鼠三阴性乳腺癌原位肿瘤模子,别离赐与禁食模仿饮食以及尺度饮食,并赐与抗PD-L1抗体或者抗OX40抗体或者两者结合医治。成果发明仅纯真赐与FMD处置惩罚就能够延缓肿瘤生长。而FMD组荷瘤小鼠接管PD-L1抗体以及抗OX40抗体的结合免疫医治后肿瘤体积显著减小。2. 接着发明免疫缺陷小鼠成立原位三阴性乳腺癌模子中,零丁处置惩罚没法按捺肿瘤生长,FMD结合免疫医治也无效。成果提醒FMD结合免疫医治的起效离不开免疫体系的介入。3. 单细胞转录组测序注解,FMD结合免疫医治组中,活化的CD8+T淋巴细胞,γδT细胞,通例CD4+T淋巴细胞和调治性T淋巴细胞细胞高度富集,此中GzmB+以及Ki-67+的细胞比例上升,瘤内的免疫按捺性细胞削减。4. 经由过程流式细胞术阐发确认FMD结合免疫医治可以对于初期耗竭的效应CD8+T淋巴细胞举行重编程,细胞从头激活。代谢组学阐发注解,FMD处置惩罚转变了4T1肿瘤的代谢模式,使其从糖酵解改变为氧化磷酸化,可能与肿瘤生长延缓相干。参考文献Fasting renders i妹妹unotherapy effective against low-i妹妹unogenic breast cancer while reducing side effects.Cell Rep.2022.请扫描二维码浏览原文2、Cell | 饮食糖引起的微生物群掉衡粉碎免疫介导的代谢综合掩护高糖高脂饮食与肥胖、糖尿病等代谢疾病紧密亲密瓜葛,但饮食详细是怎样影响肠道免疫细胞的,免疫细胞是否又能影响肥胖以及代谢综合征尚不清晰。本研究发明Th17细胞可以按捺肠上皮脂质接收,饮食中的糖会粉碎小鼠肠道菌群均衡,致使Th17细胞削减,增长代谢疾病危害。1. 研究职员起首发明高脂小鼠中在脂肪构造发生炎症变化以前,小鼠肠道免疫稳态发生变化。高脂饮食喂养的小鼠呈现了代谢综合征的特性,同时发明在小肠固有层中,高脂饮食致使Th17细胞的比例以及总数显著降低。2. 正常饮食的小鼠换到高脂饮食后,粪便以及肠道黏膜的分节丝状细菌程度迅速降低。SFB的降低先于Th17细胞的削减。提醒高脂饮食可以致使SFB的快速丢掉,从而致使Th17细胞的削减。3. 基因敲除了小鼠模子去除了肠道的Th17细胞以后,小鼠的肥胖以及代谢综合征加剧。SFB灌胃试验发明SFB灌胃小鼠在高脂饮食下的体重增长显著削减,而且防止了胰岛素抵挡以及葡萄糖耐受不良等糖尿病前期体现的发生。4. 研究职员对于高脂饮食喂养的Th17缺陷小鼠以及正常小鼠各构造中的脂质程度举行比力。发明Th17正常小鼠肠道上皮细胞以及肝脏脂质含量显著降低,但粪便中的脂质程度增长。注解在Th17细胞存在的环境下,肠道上皮细胞的脂质接收削减,同时脂质在肠腔内蓄积。Th17细胞排泄的IL-17经由过程按捺脂肪酸转运体Cd36在上皮细胞中的表达,削减脂质摄入以及接收,进而为代谢综合征提供掩护作用。参考文献Microbiota imbalance induced by dietary sugar disrupts i妹妹une-mediated protection from metabolic syndrome.Cell. 2022.请扫描二维码浏览原文3、ISME | 以基因组为中央研究奶牛胆汁酸代谢微生物群及其相干饮食引诱的功效影响胆汁酸为微生物-宿主彼此作用中主要的旌旗灯号份子,在单胃动物谷物脂肪消化接收、肠黏膜功效稳态维持、机体代谢性疾病引诱等方面阐扬着主要作用。然而,对于于反刍动物在谷物喂养期肠道内胆汁酸代谢相干的微生物群落布局及功效意义还尚不清楚。本研究经由过程胆汁酸代谢阐发与宏基因组测序展现了日粮布局对于微生物代谢胆汁酸及其侵扰肠黏膜免疫稳态的机制。1. 奶牛特异性肠道微生物的胆汁酸代谢18头奶牛的108个全肠道内容物样品的宏基因组测序显示,372个高质量微生物基因触及胆汁酸解聚、氧化以及去羟化路子。靶向胆汁酸谱阐发注解奶牛差别肠道的胆汁酸呈区段化漫衍:十二指肠以及空肠中的胆汁酸重要为低级联合胆酸,后肠中重要是次级游离胆酸。与单胃动物差别,奶牛肠道中胆汁酸代谢相干微生物重要来自Acutalibacteraceae科以及Alistipes属。2. 奶牛肠道中BSHs的分类及功效比力基因组阐发注解,携带胆汁盐水解酶的微生物遍及具备降解宿主黏液多糖能力。439个BSH同源基因可经由过程相似性收集分聚为12个Clusters,每一个Cluster因具备怪异的进化、分类、旌旗灯号肽以及生态位而阐扬着差别的功效效应。3. 谷物干涉干与重修结肠中的微生物胆汁酸谱以及宿主炎症反映谷物干涉干与实验成果注解,Cluster 1中BSHs基因品貌的增长重要与结肠微生物Firmicutes bacterium CAG-110的品貌升高有关,该类微生物品貌的升高将促成结肠胆酸浓度升高,进而致使宿主肠道炎症反映的发生。参考文献Genome-centric investigation of bile acid metabolizing microbiota of dairy cows and associated diet-induced functional implications.The ISME Journal. 2022.请扫描二维码浏览原文4、Arthritis Rheumatology | 年夜动脉炎的微生物组、代谢组以及脂质组的变化肠道菌群以及代谢调控与全身性自身免疫以及血汗管疾病有关。年夜动脉炎作为一种与免疫相干的炎症性疾病以及血汗管疾病,当前尚缺少其有关肠道菌群生态掉调及宿主代谢间的联系关系信息。本研究哄骗微生物组、代谢组以及脂质组结合阐发确立年夜动脉炎的临床表型组及多组学之间的联系关系。1. TA肠道菌群 临床指标联系关系基于发明行列步队的97份粪便样本的菌群构成与临床数据之间存在接洽,IL-2R以及病程为与菌群最相干的显著因素。基于自力验证行列步队的随机丛林阐发展现,unclassified Escherichia等11个菌群物种对于TA体现出精良的结合诊断效能。Escherichia物种以及Klebsiella pneumoniae在TA患者中的显著增长,且Escherichia物种的同源基因以及炎症指标之间存在联系关系。2. TA血浆以及粪便代谢组学 脂质组学表征血浆及粪便代谢组学展现了脂质代谢物的主要性。此中,二十三酰鞘氨醇-4-烯-1-磷酸胆碱以及1-棕榈酰溶血磷脂酸与Bifidobacterium adolescentis, Streptococcus parasanguinis, Lachnospiraceae bacterium7 1 58FAA相干。WGCNA阐发下的4个代谢物簇以及6个脂质簇可以正确区别练习急以及测试集中的TA患者。3. TA肠道菌群 代谢物/脂质 TA表型联系关系Escherichia coli, unclassified Escherichia, Streptococcus salivarius, Streptococcus parasanguinis以及Veillonella parvula在血浆脂质簇以及粪便簇介导下与炎症指标间接相干,在血浆簇及粪便簇L018介导下与TA不良预后有关;Dorea formicigenerans以及Bifidobacterium adolescentis在血浆脂质簇以及粪便簇介导下与机体、血管以及炎症指标呈负相干;在血浆簇介导下与血管类型间呈负相干。参考文献Alterations of gut microbiome, metabolome and lipidome in Takayasu arteritis.Arthritis Rheumatology. 2022.请扫描二维码浏览原文5、Science Advances | 生酮饮食展现了脑细胞差别的代谢可塑性年夜脑神经元受益于神经胶质细胞的糖酵解历程,并经由过程线粒体呼吸链/氧化磷酸化(OXPHOS)孕育发生能量;而生酮饮食孕育发生的酮领会代替糖酵解所需的部门葡萄糖。神经胶质OXPHOS突变体存在病理缺掉,在中枢神经体系细胞类型中,养分变化引诱年夜脑的代谢顺应机制尚不清晰。本研究经由过程整合多组学数据展现了致使神经炎症性疾病的细胞类型特异性代谢重塑的要害机制。1. 起首比力小鼠断奶先后发明碳水代谢、OXPHOS及突触通报功效等显著变化。断奶并食用碳水后,外周以及中枢神经体系的重要能源由母乳中的酮体替代为葡萄糖,酮分化基因集及相干卵白较着下调。2. 随后发明小鼠生酮饮食后,两组间神经认知能力无较着差异,注解持久KD喂养引诱年夜脑中的慢性酮症的同时不会引起脑毁伤。KD组中MCT1及SCOT卵白品貌、3HB显著高于比照组,注解年夜脑对于酮体的连续摄入及酮分化。3. 进一步发明在KD组中体现为酮体顺应及酮分化。代谢阐发注解星形胶质细胞始终依靠于糖酵解以及OXPHOS,重要卖力感知能量底物构成并调解代谢。神经元以及星形胶质细胞是KD组酮体的重要耗损者。4. 试验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠自己不会促成外周酮症,但会致使皮质神经元能量代谢酶上调,从而引诱神经元酮分化。EAE转变神经元朝谢的标的目的与KD组相似,而不会引起外周酮症。参考文献Ketogenic diet uncovers differential metabolic plasticity of brain cells.Science Advances. 2022.请扫描二维码浏览原文6、Science I妹妹unology | 常驻TH2细胞在相近传染的部位协调脂肪构造重塑长期炎症引诱的构造稳态由非造血细胞以及常驻免疫细胞配合介导;此中2型免疫历程是构造稳态的根蒂根基。存在于脂肪构造的多能祖细胞能孕育发生多个成纤维细胞亚群。今朝尚不清晰2型炎症怎样影响AT内基质细胞群布局以及功效。本研究基于寄生多形螺旋线虫引诱2型免疫反映展现了2型免疫的动态变化,并注解基质细胞对于双向调治素的反映对于H. polygyrus传染具备抵挡力。1. 哄骗RNA-seq、代谢组学、流式细胞术以及构造学研究传染肠道多形螺旋线虫的小鼠脂肪构造,发明传染H. polygyrus致使TH2细胞在 mAT 中堆集并出现TH2RM样表型。TH2RM细胞群扩展并永世支配mAT淋巴细胞龛。mAT以及小肠之间的界面处存在MPC。2. TH2细胞在继发传染时期协调2型免疫以及宿主防备。在富含ECM的间质空间中,存在TH2细胞的MPC群体与传染相干的扩张。这些区域在mAT以及小肠的界面处扩张。在与TH2细胞的刺激彼此作用的驱动下,激活MPC以制造ECM,与H. polygyrus的免疫有关。3. mAT基质细胞的代谢激活是对于H. polygyrus传染反映的标记。在传染断根后近一年,年夜量mAT TH2RM细胞仍旧存在。mAT中的TH2RM细胞表达Arg一、Nmur1以及Calca。 mAT TH2细胞以及mAT ILC2细胞之间的相似性,注解构造滞留促成差别2型免疫细胞的收敛性转录模式。参考文献Resident TH2 cells orchestrate adipose tissue remodeling at a site adjacent to infection.Science I妹妹unology. 2022.请扫描二维码浏览原文7、Gastroenterology | 组卵白甲基转移酶可调治T细胞脂质代谢以影响肠道炎症T细胞在炎症性肠病的发生成长中起着主要作用,T细胞固有的组卵白甲基转移酶G9a的表达与T细胞分解以及结肠炎的引诱有关,但G9a在T细胞分解中的作用机制熟悉尚不明确,对于于G9a用于医治炎症性疾病的功效还, 未有所报导。本研究经由过程转录组、代谢组、功效以及体内实验研究了G9a在人类引诱性调治T细胞(iTreg)发育中的作用。成果注解按捺G9a可以促成T细胞中的胆固醇代谢,有益于促成Treg在体外以及体内的发育。此外,本研究的数据也撑持G9a按捺剂在包孕IBD在内的免疫介导疾病的医治中的潜在运用。1. 使用G9a按捺剂处置惩罚人初始T细胞,与DMSO处置惩罚的细胞举行对于比,发明FOXP3卵白表达增长。联合高通量代谢组-转录组的通路富集阐发,证明了药物按捺G9a的活性,可在体外促成nT细胞TCR激活后自觉分解为FOXP3+ iTreg。2. G9ai -Treg的转录组以及代谢组数据都注解G9a酶活性的按捺削减了T细胞组卵白H3K9me2润色,激活SREBP依靠的胆固醇合成路子,增长了胞浆内及膜联合胆固醇,撑持线粒体能量代谢以及生物膜形成,促成向Treg细胞分解。3. 阐发UNC0642处置惩罚的小鼠脾、MLN中分散CD4+T细胞以及外周血,显示药物按捺G9a可促成小鼠体内抗原刺激的Treg扩增,减缓TNBS引诱的急性结肠炎。敲除了Treg的G9a可按捺过继性T细胞引起慢性结肠炎。参考文献G9a Modulates Lipid Metabolism in CD4 T cells to Regulate Intestinal Infla妹妹ation.Gastroenterology. 2022.请扫描二维码浏览原文8、Eur Respir J | 肠道菌群代谢物虎魄酸加剧小鼠肠道缺血/再灌注后急性肺毁伤急性肺毁伤(ALI)是肠缺血/再灌注(I/R)后病发以及灭亡的重要缘故原由。肠道菌群及其代谢产品是肠肺轴的主要调治剂。肠道菌群来历的虎魄酸可在外周构造中阐扬促炎作用,但虎魄酸是否可影响肠道I/R引诱的ALI尚不清晰。本研究展现了菌群代谢产品虎魄酸在肠道I/R引诱的肺毁伤中的作用。1. 16S rRNA菌群测序阐发发明,肠道缺血/再灌注引起肠道中的孕育发生虎魄酸的细菌品貌增长,而降解虎魄酸的细菌品貌削减,致使肺部虎魄酸堆集。2. 在无菌小鼠肺中的虎魄酸程度较着低于通例小鼠,未发明虎魄酸堆集;而在抗生素的作用下,肠道菌群的削减逆转了虎魄酸的堆集,提醒肠道菌群是肺虎魄酸的来历;在GF小鼠中移植肠I/R小鼠的粪便后,肺内虎魄酸堆集,加重小鼠肺部炎症与肺毁伤的表型。3. 机制上,虎魄酸经由过程虎魄酸受体及下流PI3K/AKT/HIF-1α通路促成肺泡巨噬细胞M1极化,致使肺泡上皮细胞凋亡以及I/R历程中的急性肺毁伤;药物断根AMs、敲除了或者阻断SUCNR1处置惩罚均可经由过程调治PI3K-AKT/HIF-1α通路逆转虎魄酸的作用,进而减轻肠道I/R致使的ALI。4. 临床上,体外轮回心脏手术患者术后初期血浆虎魄酸程度升高,且血浆虎魄酸含量与体外轮回术后肺毁伤相干指标呈显著正相干,展现虎魄酸或者是肠源性ALI医治的新靶点。参考文献Gut microbiota-derived succinate aggravates acute lung injury after intestinal ischemia/reperfusion in mice.Eur Respir J. 2022.请扫描二维码浏览原文往期保举